一体化净水处理设备能否长久正常运行，重中之重就是日常的维护与保养。细心维护，净水设备就得心应手。在一体化净水处理设备的运行时，要注意不要损坏机器，在设备的操作中应该注意以下事项：
1、防止滤料进入反渗透装置：选择合适的过滤器出水装置，防止过滤器漏砂漏活性炭;选择合适的活性炭，防止使用过程中脱粉。
2、以自来水为水源的大型纯净水设备一般都设立独立的供水系统，这样既可以保证供水系统的稳定运行，又可以减少RO系统启停时对全厂供水管网造成的瞬间冲击。当RO装置直接从原水管网上取水时，应设置高低压保护设施，因为大多数自来水管网的压力波动较大。
3、先应考虑药剂与药剂之间的兼容性，其次应考虑药剂与膜材料的兼容性。例如，RO系统中经常同时使用混凝剂，助凝剂，杀菌剂，还原剂。由于天然水中的肢体一般带负电荷，所以通常使用带正电荷的阳离子型混凝剂。为了防止R0装置结垢，RO的进水端，几乎都采用了投加阻垢剂的措施，这些阻垢剂几乎都是带有负电荷的。因此，应避免阳离子型混凝剂与阴离子型的阻垢剂发生反应，防止反应生成的胶体化合物在膜面沉积。